在第一次进攻苏州失败之后，叛军又向苏州増加了大量兵力，全军总数达到了五万余人，但上一次的失败也让马进忠心有余悸，如果再失败一次，进攻苏州的计划也就将彻底破灭了，因此马进忠虽然扩大的人马，但也不敢轻易向苏州发动进攻。
而就在这时，马进忠也接到了消息，知道商家军趁虚进取杭州，要他立刻领军回援，马进忠也不敢怠慢，而且正好可以借梯下墙，立刻收拾人马，撤离了苏州，向杭州进发。
苏州杭州之间，相隔还不到两百里的路程，大队人马行进，最多也就两三天的时间，但南京离杭州同样也不远，而且商家军又比叛军早了一天的时间出发，而且五万多大军，也不是说走就能走的，拔营起寨，整装出发，还需要不少时间，因此马进忠首先派自己手下的部将卢军，率先五千人马先行，抢先赶回杭州驻防，自己带领着大军随后而行。
直到第二天，马进忠的大军才开始出发，一路向南，走了一天，在傍晚时分，进入湖州地界，大军又安营下寨休息，准备明天再赶回杭州。而就在当天晚上，马进忠收到消息，卢军的前部人马在武康县东北地方遭到了商家军的伏击，以经全军覆没了。
马进忠得知以后，也不由大吃一惊，他就是纵横明末的农民军首领之一，绰号混十万，也征杀了十余年，虽然不敢说是精通用兵之道，但至少也是身经百战了。立刻想到，商家军这会不会是用围城打援之计呢？
其实还真叫马进忠猜对了，商毅用的，就是围城打援。其实早在制定进攻杭州的战术计划时，商毅的目地就不单纯是要收复杭州，而是要借机将叛军的主力人马也一举消灭。
因为如果只是要收复杭州，根本就不需要这么复杂，只用把大军开到杭州城下，用红夷大炮轰开城门就行了。但商毅知道，这样做仅仅只能夺下一座杭州城，如果叛军不被打灭，就会在整个浙江四处流窜，危险城外的村乡镇县，破坏性极大。又重现自己在湖广与张献忠交战的结果，虽然最后把张献忠打得全军覆没了，但整个湖广也被张献忠破坏了大半。商毅一定要避免这样的结局又在浙江出现。
于是商毅一开始用韬晦之计，引诱叛军从杭州倾巢出动，全力进攻苏州，而自己突然从南京出兵，进攻杭州，这一来叛军必然会立刻起回来救援杭州，而自已正好可以施用围城打援，首先消灭回援的叛军，将叛军的主力彻底打残，然后再收复杭州，就可以立刻平定浙江的叛乱了。整个计划其实一环扣一环，不仅周密详细，而且构思巧妙，除了商毅之外，谁都无法看淸这整个战术布局。
事实上商毅得知了苏州的叛军撤军回援杭州之后，根本就没有到杭州城下，而是将人马驻扎在武康和徳清两县之间，准备先打援军。
虽然这个时候马进忠虽然以经想到了商毅是在用围城打援之计，但也为时以睌，伏击叛军回援的前部人马，仅仅只是这整个战术布局的一部份，就在当天晚上，商毅以经布置好了一张大网，向马进忠的大军网了下来。
日暮降临之后，商家军出动了六营的兵力，分为三路，以经消消的潜伏到马进忠的大营附近。
商毅也亲自带队，在远外用望远镜观察叛军的营寨，叛军的军纪本来就十分松驰，再加上又是临时扎营，因此只扎下了供士兵休息的帐蓬，而在大营周围，即没有竖起木栅墙，也没有用战车围廓，更不可能像商家军那样，挖战壕，总之只没有修建任何保护工事，而且守夜的士兵也不多，稀稀疏疏，三三两两，整个大营，可以说是完全不设防。
看了一会儿，商毅以经淸楚，这一战是赢定了，于是放下望远镜，道：“发射信号，开始进攻。”
随着他的令下，只听“嗖嗖嗖”三声，三颗橙红色的信号弹直冲上天，在十七世纪没有工业污染的晴朗天空里，看得得十分淸楚。而士兵们也马上点燃了早就以经准备好了霹雳火箭的引线。
“嗖——嗖——嗖——嗖——”
一支又支拖着橘色火光的火箭带出锐利的破空声音，正不断的从商家军的阵地飞起，飞上了天空，然后又成排成群的向着叛军的寨中落下。
这是在叛军的营中，有不少士兵都被惊觉起来，纷纷出帐观来，只见天空中的火光也愈来愈密集，犹如一场的火雨正降下一样，向营中落了下来，绝大部份人都不知道这是什么东西，还觉得十分有趣。还有人大叫着“放焰火了？”
只见这一团火光从空中掠过，一头撞在一个帐蓬的顶上，一声剧烈的爆炸声随即传来，火光四射，那顶帐蓬瞬间就立刻全部燃烧了起来。叛军的士兵们无不惊骇，这才知道，这个不是好玩的东西，而是杀人的利器。随着火箭不断的落丌，原本只有少数灯火的营寨，此时不断的升腾起巨大的火光和爆炸声。一团团的火焰在漆黑的夜空下不时升起，有的地方显然已经完全燃烧了起来。
第一波火箭带着嘶嘶声不断的射入叛军的营寨之中，整个大营中顿时大乱起来，一时间士兵们在营中四处乱窜，到处有人在喊：“走水了”“走水了”。
这时马进忠也从自己的帐蓬里钻了出东，只见营寨里以是四处火起，人马已然是乱作一团了。而正在他惊恐之间，只听空中又传来破空的声音，从远处的地方又不断有无数火箭发射出来，一时间火箭如雨而下，落到营中不是燃起火焰，就是发出闷雷般的爆炸芦，也使叛军的整个营寨完全陷入了混乱之中，士兵们再也顾不得救火，纷纷躲避。
马进忠也不由愈看愈心惊，虽然他也知道明军有种叫“火箭”的武器，过去和官军作战时也见过，但也没觉得有什么出奇利害的地方，没有想到的是，在商家军这里运用起来，会如此可怕，仿佛什么火器一但到了商家军的手里，就会立刻厉害了十倍一样。
但现在营寨里以经到处都是火光，别说集合人马准备厮杀，就是想躲藏也没有个地方。不少士兵见势不妙，都纷纷逃离了大营。不过这时在营外等待的商家军的士兵，也从三个方面包抄围攻了上来。
因为是夜袭，又是火攻，商家军的火枪兵不敢携带火药，只能把火枪上好刺刀当长矛来使，但毕竟是不如真正的长枪好使，因此反到是是长枪兵开始呈威，而两个新兵营也还没有配备火枪，全当长枪兵使。他们接受商家军的训练最短的也超过了一个月。而且都是咬牙坚持到了现在，终于成为商家军的正式一员，这可是他们第一次以商家军的身份作战，因此也攒足了一口气，一定要努力表现。
现在叛军乱作一团，根本就无心抵抗，而且大部份人都是从睡梦中惊醒过来，慌急火急的就逃离了营寨，现在别说盔甲武器，就连衣服鞋祙都来不及穿，就是有心想和商家军作战，也是心有余而力不足，整个战局，完全呈显了一边倒的局面。
但这样的局面对商毅来说，却是求之不得，因为出战的有两个营的新兵，作战经验不足，打这种顺风战，正好有利于他们的发挥，増加作战经验和信心。
这时叛军以经全面溃败，在满是火势的营寨中纷纷乱跑，寻找逃离的出口，而遇到商家军的围追堵劫，有人冲出了围堵，但也有相当一部份人被逼得退了回来，结果人马互相来回拥挤推搡，冲撞践踏，也伤死了不少。
而啇家军却在逐渐缩小包围圈子，慢慢围陇了上来，将叛军的活动范围也逼得越来越小，许多冲不出包围圈的叛军们见大势己去，又无路可走了，也只能弃械投降。所抓的俘虏也不在少数。
当然商家军毕竟人数不多，因此还是有不少叛军趁着混乱，杀出了重围，四散逃开。基中就包括主将马进忠，他的身边有几十名玄皇教众，都是武功好手，再加上又见机得快，在他们的保护之下，又趁着商家军的包围还没有形成，终于逃脫了出去。然后又收陇了一些败兵，向杭州逃窜。
不过杀出了重围，也并不意味着就逃脱了，因为商毅以经打定了主意，必须彻底击溃叛军的主力，因此也安排下第二批堵截的人马，就是骑兵营。
这时天色以经渐亮，正好可以让骑兵施展。因为叛军是四散而逃，因此杨武丞也把骑兵分散，以连为单位，各自为战追击叛军。而逃脱出来的叛军折腾了一夜，早就是累得精疲力竭，那里还有精力迎战，而且叛军几乎全是步兵，根本无发抵挡骑兵的冲击，基本是一冲就散。
马进忠虽然收陇了近三千多残兵败将，但也正因为他聚陇的人多，目标也由为显著，被三个骑兵连盯上，连挨了几轮骑兵的冲锋，好不容易聚陇的人马，又被冲得四分五裂了。